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簡介
高通量基因組分析是生命科學研究中不可或缺的重要工具,這項技術在推動科研進步方面發(fā)揮著
至關重要的作用。為了滿足了科研領域對高效、準確制備方法的迫切需求,seqWell 的 Express Plex?
Library Kit 提供了一種專門用于高通量制備質粒和擴增子文庫的解決方案。
在傳統(tǒng)的手工制備文庫方法中,完成 96 個樣品的制備需要耗費長達 90 分鐘的時間,其中手動操
作時間占據(jù)了 30 分鐘。這種方式不僅效率低下,還容易因為人為因素引入誤差。
為了改進這一狀況,本文對比了兩種文庫制備方法,一種是在 Opentrons Flex? 移液工作站上使用
seqWell ExpressPlex? Library Kit ,另一種是手工制備文庫。
通過結合 Flex 移液工作站與 seqWell ExpressPlex? Library Kit,我們可以顯著縮短文庫制備時
間,提高樣本通量。這種自動化的解決方案不僅提升了制備效率,還降低了人為誤差的風險,為生命科學
研究提供了更為可靠、高效的工具。
材料與方法
ExpressPlex 工作流程:
根據(jù) Express Plex 的工作流程,我們在 Flex 自動化移液工作站上進行文庫制備。實驗過程中,我們輸入
16 ng 的 pUC19 ,再將所有組分加入反應板 , 用 3000 rpm 的轉速混勻 90 秒,然后進行后續(xù)的文庫制
備和混合步驟。最終的文庫在 NextSeq 2000 測序儀上進行 2X150 bp 測序。

圖 1.
A ) Express Plex 工作流程包括將 index 和 DNA 加入 反應板(已含有酶等混合物),然后進行擴增、混合
和 MAGwise 磁珠純化;
B ) Flex 工作站包括吸頭盒、模塊、轉板抓手和其他配件;
C ) Flex 工作站板位設置,用于在擴增后將 4 個反應板進行文庫混合。
結果

圖 2 . A ) 結果顯示 96 孔板中文庫數(shù)據(jù)變異系數(shù)( CV )為 12.7%; B ) 95% 的文庫數(shù)據(jù)通過了數(shù)據(jù)預處
理,為高質量數(shù)據(jù),且超過 90% 文庫質量得分達到 Q30; C ) 由 Flex 制備的文庫比手動制備的文庫濃度
更高。

圖 3 . 利用錯開的開始時間,可以在 Opentrons FlexTM 上 3 小時內制備 8 個獨立的 96 混 1 文
庫。在 Flex 上設置第一塊反應板后,可以在 24 小時內完成 768 個文庫的制備。
結論
在 Flex 移液平臺上制備的 96 個 pUC19 質粒樣本文庫呈現(xiàn)出了高度均一的質量,充分證明了 Flex
平臺在自動化文庫制備方面的卓越性能。
與手動制備相比,自動化文庫制備不僅穩(wěn)定性更佳,而且文庫濃度更高。此外,超過95%的讀數(shù)成
功通過測序儀質檢 PF,這進一步驗證了自動化制備流程的高效性和準確性。
Flex 移液工作站支持在單次運行中處理多達 384 個樣本,極大地提高了樣本處理效率。通過合理
安排時間,我們甚至可以在 24 小時內處理高達 768 個樣本,從而滿足大規(guī)模高通量基因組分析的需求。
在 Flex 平臺上自動化 ExpressPlex? Library Prep Kit 工作流程,我們實現(xiàn)了從提取的質粒/擴增
子 DNA 到數(shù)據(jù)生成的全流程自動化。這一解決方案不僅簡化了操作步驟,降低了人為誤差,而且顯著提
高了實驗效率和數(shù)據(jù)質量,為生命科學研究領域的發(fā)展注入了新的動力。
經(jīng)驗豐富的服務團隊和強大的生產(chǎn)支持團隊為客戶提供無憂的訂單服務。
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